La precedente infezione da Omicron BA.1 non protegge dalla variante BA.2

Un nuovo studio condotto da ricercatori dello Statens Serum Institut-Danimarca insieme a scienziati dell’Università di Copenaghen-Danimarca, dell’Università della Danimarca e della Deakin University-Australia hanno scoperto che la precedente infezione da Omicron BA.1 non protegge dalla variante BA.2.

I risultati dello studio sono stati pubblicati su un server di prestampa e sono attualmente in fase di revisione paritaria. https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2022.02.19.22271112v1

Il presente studio conferma il verificarsi della reinfezione di Omicron BA.2 subito dopo una precedente infezione da BA.1. Questo è a nostra conoscenza il primo studio che riporta casi aggregati di reinfezione di Omicron BA.2 e documenta un intervallo di tempo di appena 20 giorni dopo l’infezione iniziale.

Tra i 1.848.466 milioni di individui infetti nel periodo di studio, abbiamo identificato 1.739 casi che soddisfacevano i criteri di due campioni positivi con più di 20 e meno di 60 giorni di distanza. Da un gruppo selezionato casualmente di 263 campioni accoppiati che sono stati analizzati con successo da WGS, abbiamo trovato 187 (71%) casi di reinfezioni e 47 (18%) di questi erano reinfezioni di Omicron BA.1-BA.2.

Il tasso di reinfezione sembra essere basso dato l’alto numero di test SARS-CoV-2 positivi durante il periodo di studio, ma evidenzia ancora la necessità di una valutazione continua della durata dell’immunità indotta dal vaccino e/o naturale. Dato il breve periodo di tempo tra le infezioni potrebbe essere ragionevole rivalutare la definizione dell’ECDC che richiede due campioni positivi con più di 60 giorni di distanza per considerare la reinfezione.

Le reinfezioni di Omicron BA.2 dopo infezioni iniziali Delta o BA.1 sono state osservate principalmente tra i giovani di età inferiore ai 30 anni e la maggior parte di questi casi non è stata vaccinata, sottolineando ulteriormente la maggiore immunità ottenuta dalla combinazione di vaccinazione e infezione rispetto solo all’immunità indotta da infezioni. Per la reinfezione da Omicron da BA.1 a BA.2 tra i casi di età pari o superiore a 15 anni, solo il 13% (3/24) aveva completato il programma di vaccinazione primaria, contrariamente al tasso di vaccinazione complessivo in Danimarca di >80%.

Le reinfezioni erano caratterizzate da sintomi complessivamente lievi paragonabili all’infezione iniziale e non portavano né al ricovero né alla morte. È tuttavia sorprendente che soprattutto i bambini e gli adolescenti vengano reinfettati, poiché i bambini in misura maggiore rispetto agli adulti sviluppano un’immunità crociata prolungata ¹⁶ .

Ciò può essere spiegato dall’incidenza molto elevata tra i bambini nel periodo di studio prescelto, mentre gli adulti e gli anziani avevano un’incidenza inferiore. È stato notato un cambiamento nell’indicazione per il test tra la prima e la seconda infezione e ciò potrebbe riflettere un cambiamento generale nel motivo per cui gli individui vengono testati nel tempo. 

Con l’eliminazione delle infezioni e delle restrizioni più diffuse, l’urgenza di eseguire il test a causa dell’esposizione a una persona risultata positiva potrebbe essere stata ridotta in generale, portando a un aumento della percentuale di individui testati a causa dei sintomi.

Per valutare se i casi di reinfezione di Omicron BA.2 sono causati da un sottoinsieme specifico di varianti BA.2 circolanti con proprietà intrinsecamente diverse rispetto a BA.2 in generale, abbiamo confrontato i campioni accoppiati con genomi BA.1 e BA.2 danesi campionati casualmente . Qui non abbiamo trovato alcun segno di raggruppamento tra le varianti BA.2 o BA.1 coinvolte nella reinfezione rispetto alle sequenze BA.1 e BA.2 selezionate casualmente.

Anche le differenze nel gruppo di età e nello stato di vaccinazione tra i dati di reinfezione accoppiati e i dati campionati casualmente non hanno dato origine ad alcun raggruppamento. Ciò indica che la capacità di Omicron BA.2 di causare reinfezione nei casi di Omicron BA.1 infetti di recente con protezione vaccinale bassa o assente può essere una proprietà intrinseca di BA.2. Per i casi Omicron BA.1-BA.1, abbiamo riscontrato che i genomi sono quasi identici (0-1 SNP) nella maggior parte dei casi, indicando così un’infezione residua.

Abbiamo osservato una carica virale complessiva significativamente ridotta nei campioni di infezione secondaria BA.2 rispetto all’infezione iniziale insieme a un rapporto inferiore tra RNA subgenomico e genomico. Nel complesso, questo può indicare un’infezione secondaria più superficiale e transitoria che potrebbe essere spiegata dall’immunità mediata dai linfociti T ottenuta durante la prima infezione ¹⁷ .

In precedenza abbiamo ipotizzato che le infezioni nella fase iniziale possano essere associate al pattern che vediamo qui per la popolazione dello studio Omicron BA.2 ¹⁸ , ed è possibile che l’infezione da BA.2 in questi individui si verifichi entro una breve finestra dopo un’infezione iniziale da BA.1, può in qualche modo differire, forse essendo più superficiale o transitoria rispetto alle infezioni da BA.2 osservate nei campioni selezionati casualmente utilizzati per il confronto.

In conclusione, forniamo prove che le reinfezioni da Omicron BA.2 sono rare ma possono verificarsi relativamente poco dopo un’infezione da BA.1, causando per lo più una malattia lieve nei giovani non vaccinati. Le reinfezioni sono state identificate tra i casi di SARS-CoV-2 risultati positivi per più di una volta in un paese con un’elevata capacità di test PCR e un’ampia trasmissione comunitaria.